Для независимой установки нужно создать два раздела. Затем на один из них установить WindowsXP, на второй WindowsME/98. После установки замечаем что ME затер загрузочную запись XP, теперь грузимся в чистый дос и запускаем BOOTMENU
bmi.com d0 54 WinXP=0 WinME=1
d0 - обозначает жесткий диск, на котором производятся все операции
54 - время